Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms