Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YU88

Gm3147, Predicted gene 3147, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3147A0A0J9YU88 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3147A0A0J9YU88 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms