Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Scn2aA0A0J9YTW6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Scn2aA0A0J9YTW6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Scn2aA0A0J9YTW6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Scn2aA0A0J9YTW6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Scn2aA0A0J9YTW6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Scn2aA0A0J9YTW6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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