Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
KNOP1Q1ED39 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
KNOP1Q1ED39 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
KNOP1Q1ED39 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
KNOP1Q1ED39 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
KNOP1Q1ED39 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
KNOP1Q1ED39 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
KNOP1Q1ED39 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
KNOP1Q1ED39 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
KNOP1Q1ED39 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
KNOP1Q1ED39 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
KNOP1Q1ED39 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
KNOP1Q1ED39 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
KNOP1Q1ED39 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-4.64□□□□□ -3.15
KNOP1Q1ED39 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
KNOP1Q1ED39 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-4.94□□□□□ -3.2
KNOP1Q1ED39 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-5.55□□□□□ -3.3
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