Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
DDX39BQ13838 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
DDX39BQ13838 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
DDX39BQ13838 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-4.76□□□□□ -3.17
DDX39BQ13838 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-4.76□□□□□ -3.17
DDX39BQ13838 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-4.78□□□□□ -3.17
DDX39BQ13838 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-4.84□□□□□ -3.18
DDX39BQ13838 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-4.89□□□□□ -3.19
DDX39BQ13838 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-4.89□□□□□ -3.19
DDX39BQ13838 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-4.9□□□□□ -3.19
DDX39BQ13838 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-4.93□□□□□ -3.2
DDX39BQ13838 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-4.94□□□□□ -3.2
DDX39BQ13838 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
DDX39BQ13838 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-5.21□□□□□ -3.24
DDX39BQ13838 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-5.21□□□□□ -3.24
DDX39BQ13838 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-5.22□□□□□ -3.25
DDX39BQ13838 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-5.32□□□□□ -3.26
DDX39BQ13838 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
DDX39BQ13838 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-5.46□□□□□ -3.28
DDX39BQ13838 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-5.57□□□□□ -3.3
DDX39BQ13838 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-5.73□□□□□ -3.33
DDX39BQ13838 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-5.89□□□□□ -3.35
DDX39BQ13838 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-5.92□□□□□ -3.36
DDX39BQ13838 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-6.26□□□□□ -3.41
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 2.8 ms