Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
LSAMPQ13449 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
LSAMPQ13449 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
LSAMPQ13449 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
LSAMPQ13449 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
LSAMPQ13449 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
LSAMPQ13449 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
LSAMPQ13449 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
LSAMPQ13449 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
LSAMPQ13449 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
LSAMPQ13449 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
LSAMPQ13449 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
LSAMPQ13449 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
LSAMPQ13449 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
LSAMPQ13449 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
LSAMPQ13449 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
LSAMPQ13449 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
LSAMPQ13449 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
LSAMPQ13449 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
LSAMPQ13449 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
LSAMPQ13449 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
LSAMPQ13449 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-4.66□□□□□ -3.16
LSAMPQ13449 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-5.1□□□□□ -3.23
LSAMPQ13449 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-5.41□□□□□ -3.28
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 239 ms