Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-6.23□□□□□ -3.41
TCOF1Q13428 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-6.28□□□□□ -3.41
TCOF1Q13428 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-6.3□□□□□ -3.42
TCOF1Q13428 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-6.3□□□□□ -3.42
TCOF1Q13428 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-6.31□□□□□ -3.42
TCOF1Q13428 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-6.32□□□□□ -3.42
TCOF1Q13428 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-6.32□□□□□ -3.42
TCOF1Q13428 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-6.34□□□□□ -3.42
TCOF1Q13428 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-6.37□□□□□ -3.43
TCOF1Q13428 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-6.38□□□□□ -3.43
TCOF1Q13428 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-6.53□□□□□ -3.45
TCOF1Q13428 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-6.66□□□□□ -3.48
TCOF1Q13428 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-6.78□□□□□ -3.49
TCOF1Q13428 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-6.81□□□□□ -3.5
TCOF1Q13428 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-7.03□□□□□ -3.53
TCOF1Q13428 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-7.08□□□□□ -3.54
TCOF1Q13428 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-7.22□□□□□ -3.56
TCOF1Q13428 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-7.25□□□□□ -3.57
TCOF1Q13428 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-7.35□□□□□ -3.59
TCOF1Q13428 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-7.37□□□□□ -3.59
TCOF1Q13428 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-7.48□□□□□ -3.61
TCOF1Q13428 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-7.61□□□□□ -3.63
TCOF1Q13428 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-7.68□□□□□ -3.64
TCOF1Q13428 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-7.68□□□□□ -3.64
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 427 ms