Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SP140Q13342 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SP140Q13342 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SP140Q13342 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SP140Q13342 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SP140Q13342 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SP140Q13342 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SP140Q13342 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SP140Q13342 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
SP140Q13342 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
SP140Q13342 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SP140Q13342 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SP140Q13342 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SP140Q13342 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
SP140Q13342 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SP140Q13342 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
SP140Q13342 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SP140Q13342 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
SP140Q13342 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SP140Q13342 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
SP140Q13342 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
SP140Q13342 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
SP140Q13342 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
SP140Q13342 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-5.24□□□□□ -3.25
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms