Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
TRIM28Q13263 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
TRIM28Q13263 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TRIM28Q13263 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
TRIM28Q13263 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TRIM28Q13263 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TRIM28Q13263 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TRIM28Q13263 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
TRIM28Q13263 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
TRIM28Q13263 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
TRIM28Q13263 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
TRIM28Q13263 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
TRIM28Q13263 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TRIM28Q13263 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TRIM28Q13263 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TRIM28Q13263 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRIM28Q13263 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TRIM28Q13263 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
TRIM28Q13263 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
TRIM28Q13263 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
TRIM28Q13263 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TRIM28Q13263 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
TRIM28Q13263 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
TRIM28Q13263 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
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