Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
IFT88Q13099 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
IFT88Q13099 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
IFT88Q13099 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
IFT88Q13099 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
IFT88Q13099 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
IFT88Q13099 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
IFT88Q13099 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
IFT88Q13099 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
IFT88Q13099 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
IFT88Q13099 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
IFT88Q13099 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
IFT88Q13099 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
IFT88Q13099 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
IFT88Q13099 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
IFT88Q13099 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
IFT88Q13099 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
IFT88Q13099 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
IFT88Q13099 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
IFT88Q13099 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
IFT88Q13099 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
IFT88Q13099 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
IFT88Q13099 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
IFT88Q13099 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-4.81□□□□□ -3.18
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 446.8 ms