Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
TRAF1Q13077 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
TRAF1Q13077 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
TRAF1Q13077 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
TRAF1Q13077 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TRAF1Q13077 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TRAF1Q13077 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
TRAF1Q13077 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
TRAF1Q13077 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
TRAF1Q13077 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
TRAF1Q13077 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
TRAF1Q13077 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
TRAF1Q13077 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
TRAF1Q13077 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
TRAF1Q13077 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
TRAF1Q13077 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
TRAF1Q13077 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
TRAF1Q13077 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
TRAF1Q13077 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
TRAF1Q13077 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
TRAF1Q13077 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
TRAF1Q13077 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
TRAF1Q13077 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
TRAF1Q13077 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-4.72□□□□□ -3.17
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 2.2 ms