Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
TMOD1P28289 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
TMOD1P28289 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
TMOD1P28289 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
TMOD1P28289 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
TMOD1P28289 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
TMOD1P28289 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
TMOD1P28289 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
TMOD1P28289 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
TMOD1P28289 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
TMOD1P28289 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
TMOD1P28289 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
TMOD1P28289 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
TMOD1P28289 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
TMOD1P28289 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
TMOD1P28289 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
TMOD1P28289 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
TMOD1P28289 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
TMOD1P28289 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
TMOD1P28289 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
TMOD1P28289 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
TMOD1P28289 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
TMOD1P28289 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
TMOD1P28289 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.21
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.1 ms