Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
PTPREP23469 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
PTPREP23469 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
PTPREP23469 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
PTPREP23469 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
PTPREP23469 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
PTPREP23469 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
PTPREP23469 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
PTPREP23469 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
PTPREP23469 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
PTPREP23469 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
PTPREP23469 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PTPREP23469 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
PTPREP23469 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
PTPREP23469 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
PTPREP23469 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
PTPREP23469 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
PTPREP23469 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
PTPREP23469 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
PTPREP23469 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
PTPREP23469 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
PTPREP23469 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
PTPREP23469 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
PTPREP23469 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 3.4 ms