Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
PTPRDP23468 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
PTPRDP23468 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
PTPRDP23468 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
PTPRDP23468 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-4.46□□□□□ -3.12
PTPRDP23468 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
PTPRDP23468 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
PTPRDP23468 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
PTPRDP23468 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
PTPRDP23468 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
PTPRDP23468 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-4.7□□□□□ -3.16
PTPRDP23468 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-4.71□□□□□ -3.16
PTPRDP23468 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-4.8□□□□□ -3.18
PTPRDP23468 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-4.87□□□□□ -3.19
PTPRDP23468 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-4.93□□□□□ -3.2
PTPRDP23468 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-5□□□□□ -3.21
PTPRDP23468 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-5□□□□□ -3.21
PTPRDP23468 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-5.1□□□□□ -3.23
PTPRDP23468 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-5.18□□□□□ -3.24
PTPRDP23468 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-5.29□□□□□ -3.26
PTPRDP23468 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-5.29□□□□□ -3.26
PTPRDP23468 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-5.32□□□□□ -3.26
PTPRDP23468 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-5.33□□□□□ -3.26
PTPRDP23468 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-5.42□□□□□ -3.28
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 3.6 ms