Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRNQ16849 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRNQ16849 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRNQ16849 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRNQ16849 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRNQ16849 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRNQ16849 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRNQ16849 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRNQ16849 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRNQ16849 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRNQ16849 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
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PTPRNQ16849 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
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PTPRNQ16849 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRNQ16849 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRNQ16849 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRNQ16849 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
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PTPRNQ16849 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRNQ16849 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRNQ16849 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRNQ16849 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRNQ16849 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRNQ16849 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRNQ16849 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRNQ16849 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRNQ16849 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRNQ16849 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRNQ16849 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRNQ16849 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRNQ16849 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRNQ16849 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPRNQ16849 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPRNQ16849 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRNQ16849 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRNQ16849 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRNQ16849 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRNQ16849 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRNQ16849 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRNQ16849 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRNQ16849 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRNQ16849 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRNQ16849 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRNQ16849 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRNQ16849 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
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PTPRNQ16849 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
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PTPRNQ16849 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PTPRNQ16849 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
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PTPRNQ16849 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPRNQ16849 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPRNQ16849 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPRNQ16849 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRNQ16849 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRNQ16849 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
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