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Protein–RNA interactions for Protein: Q13515
BFSP2, Phakinin, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
BFSP2
Q13515
MIR664B-201
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BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
BFSP2
Q13515
RNU6-983P-201
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103 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
BFSP2
Q13515
RNU6ATAC14P-201
ENST00000516218
91 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
BFSP2
Q13515
RNU6-1340P-201
ENST00000384438
107 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
BFSP2
Q13515
CR2-207
ENST00000640301
151 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
BFSP2
Q13515
RNU6-854P-201
ENST00000364036
107 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
BFSP2
Q13515
MIR4748-201
ENST00000578076
82 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
BFSP2
Q13515
Y_RNA.211-201
ENST00000364164
101 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
BFSP2
Q13515
Y_RNA.468-201
ENST00000384298
102 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
BFSP2
Q13515
Y_RNA.519-201
ENST00000384553
102 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
BFSP2
Q13515
MIR198-201
ENST00000637333
62 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
BFSP2
Q13515
Y_RNA.406-201
ENST00000383984
100 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
BFSP2
Q13515
Y_RNA.232-201
ENST00000364369
96 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
BFSP2
Q13515
Y_RNA.284-201
ENST00000364806
102 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
BFSP2
Q13515
MIR601-201
ENST00000385256
79 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
BFSP2
Q13515
RNU6-118P-201
ENST00000516552
102 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
BFSP2
Q13515
Y_RNA.501-201
ENST00000384467
103 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
BFSP2
Q13515
TRAJ33-201
ENST00000390504
57 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
BFSP2
Q13515
RNU6-133P-201
ENST00000383989
107 nt
BASIC
-1.24
□□□□□ -2.61
BFSP2
Q13515
hsa-mir-3607.1-201
ENST00000637229
79 nt
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
BFSP2
Q13515
RNA5SP405-201
ENST00000363059
114 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
BFSP2
Q13515
RNU6ATAC32P-201
ENST00000516026
76 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
BFSP2
Q13515
RNU6-1091P-201
ENST00000363945
107 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
BFSP2
Q13515
Y_RNA.442-201
ENST00000384131
102 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
BFSP2
Q13515
Y_RNA.564-201
ENST00000384708
106 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
BFSP2
Q13515
AL731768.1-201
ENST00000603124
139 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
BFSP2
Q13515
RNU6-194P-201
ENST00000363862
105 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
BFSP2
Q13515
RNA5SP461-201
ENST00000516451
104 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
BFSP2
Q13515
RNY4P9-201
ENST00000363194
97 nt
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
BFSP2
Q13515
MIR4723-201
ENST00000585070
81 nt
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
BFSP2
Q13515
MIR1246-201
ENST00000636535
73 nt
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
BFSP2
Q13515
RNU6-737P-201
ENST00000365370
107 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
BFSP2
Q13515
RNU6-1277P-201
ENST00000364561
107 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
BFSP2
Q13515
RNU6-1043P-201
ENST00000410355
99 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
BFSP2
Q13515
Y_RNA.413-201
ENST00000384007
102 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
BFSP2
Q13515
Y_RNA.754-201
ENST00000476024
102 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
BFSP2
Q13515
Y_RNA.790-201
ENST00000614282
102 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
BFSP2
Q13515
Y_RNA.782-201
ENST00000614695
102 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
BFSP2
Q13515
SNX3P1Y-201
ENST00000615757
176 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
BFSP2
Q13515
RNU6-422P-201
ENST00000384632
107 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
BFSP2
Q13515
MIR124-1-201
ENST00000385275
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BASIC
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□□□□□ -2.64
BFSP2
Q13515
MIR1285-2-201
ENST00000408311
88 nt
BASIC
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□□□□□ -2.64
BFSP2
Q13515
RNA5SP180-201
ENST00000516181
101 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
BFSP2
Q13515
U4.2-201
ENST00000618561
85 nt
BASIC
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□□□□□ -2.64
BFSP2
Q13515
Y_RNA.181-201
ENST00000363872
101 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
BFSP2
Q13515
Y_RNA.663-201
ENST00000516043
101 nt
BASIC
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□□□□□ -2.64
BFSP2
Q13515
RNU6-1161P-201
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102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.64
BFSP2
Q13515
RNU6-894P-201
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105 nt
BASIC
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□□□□□ -2.64
BFSP2
Q13515
MIR365A-201
ENST00000362260
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BASIC
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□□□□□ -2.64
BFSP2
Q13515
Y_RNA.513-201
ENST00000384522
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BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
BFSP2
Q13515
AL359920.1-201
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176 nt
BASIC
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□□□□□ -2.64
BFSP2
Q13515
Y_RNA.59-201
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BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
BFSP2
Q13515
Y_RNA.543-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.64
BFSP2
Q13515
SNORD114-3-201
ENST00000364969
75 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
BFSP2
Q13515
MIR4441-201
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100 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
BFSP2
Q13515
TARS-215
ENST00000626210
201 nt
TSL 5
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
BFSP2
Q13515
MIR548AH-201
ENST00000637109
76 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
BFSP2
Q13515
MIR3139-201
ENST00000579145
76 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
BFSP2
Q13515
RNU6-1024P-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.65
BFSP2
Q13515
Y_RNA.612-201
ENST00000410717
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BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
BFSP2
Q13515
VTRNA2-1-201
ENST00000602301
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BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
BFSP2
Q13515
MIRLET7A3-201
ENST00000362116
74 nt
BASIC
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□□□□□ -2.65
BFSP2
Q13515
Y_RNA.137-201
ENST00000363455
112 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
BFSP2
Q13515
SNORD115-45-201
ENST00000391078
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BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
BFSP2
Q13515
MIR1207-201
ENST00000408249
87 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
BFSP2
Q13515
RNU6-1306P-201
ENST00000365219
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BASIC
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□□□□□ -2.66
BFSP2
Q13515
Y_RNA.652-201
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BASIC
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□□□□□ -2.66
BFSP2
Q13515
RNY4P25-201
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BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
BFSP2
Q13515
Y_RNA.225-201
ENST00000364326
97 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
BFSP2
Q13515
RNU6-620P-201
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96 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
BFSP2
Q13515
MT-TM-201
ENST00000387377
68 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
BFSP2
Q13515
MIR5693-201
ENST00000577722
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BASIC
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□□□□□ -2.66
BFSP2
Q13515
Y_RNA.616-201
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BASIC
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□□□□□ -2.66
BFSP2
Q13515
Y_RNA.55-201
ENST00000362797
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BASIC
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□□□□□ -2.67
BFSP2
Q13515
MIR548T-201
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74 nt
BASIC
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□□□□□ -2.67
BFSP2
Q13515
Y_RNA.79-201
ENST00000362992
113 nt
BASIC
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□□□□□ -2.68
BFSP2
Q13515
SNORD114-13-201
ENST00000364377
74 nt
BASIC
-1.67
□□□□□ -2.68
BFSP2
Q13515
Y_RNA.397-201
ENST00000383950
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BASIC
-1.67
□□□□□ -2.68
BFSP2
Q13515
RNY4P27-201
ENST00000363341
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BASIC
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BFSP2
Q13515
RNU6-627P-201
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BASIC
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BFSP2
Q13515
Y_RNA.266-201
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96 nt
BASIC
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□□□□□ -2.68
BFSP2
Q13515
Y_RNA.830-201
ENST00000628531
96 nt
BASIC
-1.74
□□□□□ -2.69
BFSP2
Q13515
RNU6-1044P-201
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107 nt
BASIC
-1.75
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BFSP2
Q13515
RNU6-230P-201
ENST00000362457
104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.69
BFSP2
Q13515
Y_RNA.475-201
ENST00000384345
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BASIC
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□□□□□ -2.7
BFSP2
Q13515
RNU6-1247P-201
ENST00000516622
98 nt
BASIC
-1.84
□□□□□ -2.7
BFSP2
Q13515
Y_RNA.684-201
ENST00000516510
99 nt
BASIC
-1.86
□□□□□ -2.71
BFSP2
Q13515
SOX2OT_exon4.1-201
ENST00000610449
109 nt
BASIC
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□□□□□ -2.71
BFSP2
Q13515
RNU4-85P-201
ENST00000364675
123 nt
BASIC
-1.88
□□□□□ -2.71
BFSP2
Q13515
RNU6-119P-201
ENST00000364882
107 nt
BASIC
-1.89
□□□□□ -2.71
BFSP2
Q13515
MIR496-201
ENST00000385226
102 nt
BASIC
-1.9
□□□□□ -2.71
BFSP2
Q13515
SNORD54-201
ENST00000459159
67 nt
BASIC
-2
□□□□□ -2.73
BFSP2
Q13515
RNA5SP449-201
ENST00000516871
130 nt
BASIC
-2
□□□□□ -2.73
BFSP2
Q13515
Y_RNA.165-201
ENST00000363721
102 nt
BASIC
-2.01
□□□□□ -2.73
BFSP2
Q13515
RNU6-665P-201
ENST00000384639
107 nt
BASIC
-2.01
□□□□□ -2.73
BFSP2
Q13515
Y_RNA.228-201
ENST00000364346
98 nt
BASIC
-2.02
□□□□□ -2.73
BFSP2
Q13515
MIR509-1-201
ENST00000385265
94 nt
BASIC
-2.06
□□□□□ -2.74
BFSP2
Q13515
MIR509-2-201
ENST00000390724
91 nt
BASIC
-2.06
□□□□□ -2.74
BFSP2
Q13515
Y_RNA.658-201
ENST00000515990
97 nt
BASIC
-2.08
□□□□□ -2.74
BFSP2
Q13515
RNU6-1191P-201
ENST00000516799
107 nt
BASIC
-2.09
□□□□□ -2.74
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