Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
FOXE3Q13461 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
FOXE3Q13461 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
FOXE3Q13461 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
FOXE3Q13461 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
FOXE3Q13461 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
FOXE3Q13461 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
FOXE3Q13461 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
FOXE3Q13461 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
FOXE3Q13461 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
FOXE3Q13461 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
FOXE3Q13461 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
FOXE3Q13461 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
FOXE3Q13461 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
FOXE3Q13461 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
FOXE3Q13461 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
FOXE3Q13461 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
FOXE3Q13461 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
FOXE3Q13461 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
FOXE3Q13461 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
FOXE3Q13461 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
FOXE3Q13461 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
FOXE3Q13461 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
FOXE3Q13461 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
FOXE3Q13461 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
FOXE3Q13461 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
FOXE3Q13461 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
FOXE3Q13461 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
FOXE3Q13461 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
FOXE3Q13461 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
FOXE3Q13461 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
FOXE3Q13461 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
FOXE3Q13461 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
FOXE3Q13461 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
FOXE3Q13461 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
FOXE3Q13461 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
FOXE3Q13461 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
FOXE3Q13461 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
FOXE3Q13461 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
FOXE3Q13461 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
FOXE3Q13461 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
FOXE3Q13461 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
FOXE3Q13461 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
FOXE3Q13461 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
FOXE3Q13461 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
FOXE3Q13461 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
FOXE3Q13461 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
FOXE3Q13461 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
FOXE3Q13461 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
FOXE3Q13461 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
FOXE3Q13461 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
FOXE3Q13461 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
FOXE3Q13461 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
FOXE3Q13461 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
FOXE3Q13461 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.27□□□□□ -2.61
FOXE3Q13461 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
FOXE3Q13461 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
FOXE3Q13461 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
FOXE3Q13461 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
FOXE3Q13461 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
FOXE3Q13461 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
FOXE3Q13461 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
FOXE3Q13461 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
FOXE3Q13461 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
FOXE3Q13461 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
FOXE3Q13461 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
FOXE3Q13461 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
FOXE3Q13461 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
FOXE3Q13461 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
FOXE3Q13461 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
FOXE3Q13461 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
FOXE3Q13461 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
FOXE3Q13461 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
FOXE3Q13461 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
FOXE3Q13461 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
FOXE3Q13461 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
FOXE3Q13461 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
FOXE3Q13461 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
FOXE3Q13461 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
FOXE3Q13461 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
FOXE3Q13461 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
FOXE3Q13461 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
FOXE3Q13461 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
FOXE3Q13461 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
FOXE3Q13461 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
FOXE3Q13461 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
FOXE3Q13461 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
FOXE3Q13461 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
FOXE3Q13461 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
FOXE3Q13461 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
FOXE3Q13461 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
FOXE3Q13461 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
FOXE3Q13461 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
FOXE3Q13461 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
FOXE3Q13461 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
FOXE3Q13461 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
FOXE3Q13461 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
FOXE3Q13461 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
FOXE3Q13461 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
FOXE3Q13461 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms