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Protein–RNA interactions for Protein: Q14563
SEMA3A, Semaphorin-3A, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SEMA3A
Q14563
AC091912.2-201
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167 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
SEMA3A
Q14563
RNU6-79P-201
ENST00000362511
107 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SEMA3A
Q14563
RNU6-822P-201
ENST00000362707
106 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SEMA3A
Q14563
RNU6-59P-201
ENST00000384787
107 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SEMA3A
Q14563
MIR196A1-201
ENST00000388006
70 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SEMA3A
Q14563
RNU6-1326P-201
ENST00000391262
107 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SEMA3A
Q14563
MIR3681-201
ENST00000580089
72 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SEMA3A
Q14563
RNU6-1236P-201
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99 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
SEMA3A
Q14563
MIR4499-201
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69 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
SEMA3A
Q14563
MIR4317-201
ENST00000637586
65 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.345-201
ENST00000365384
92 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
SEMA3A
Q14563
RNU6-695P-201
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104 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.781-201
ENST00000620301
103 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.320-201
ENST00000365144
102 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
SEMA3A
Q14563
MIR8485-201
ENST00000401372
91 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
SEMA3A
Q14563
SMAD5-AS1_3.1-201
ENST00000614187
124 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
SEMA3A
Q14563
uc_338.19-201
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99 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.514-201
ENST00000384528
112 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
SEMA3A
Q14563
RNU6-576P-201
ENST00000390854
102 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
SEMA3A
Q14563
RNU6-176P-201
ENST00000517196
105 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
SEMA3A
Q14563
MIR4723-201
ENST00000585070
81 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.583-201
ENST00000391033
113 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
SEMA3A
Q14563
SNORD18C-201
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69 nt
BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.206-201
ENST00000364136
102 nt
BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
SEMA3A
Q14563
MIR548AJ2-201
ENST00000408539
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BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
SEMA3A
Q14563
SNORD83B-201
ENST00000386745
93 nt
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.382-201
ENST00000365672
114 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
SEMA3A
Q14563
MIR587-201
ENST00000384845
96 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
SEMA3A
Q14563
RNU6-912P-201
ENST00000363800
104 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.129-201
ENST00000363392
110 nt
BASIC
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□□□□□ -2.53
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.365-201
ENST00000365537
102 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.449-201
ENST00000384187
102 nt
BASIC
-0.77
□□□□□ -2.53
SEMA3A
Q14563
RNU6-400P-201
ENST00000391173
106 nt
BASIC
-0.77
□□□□□ -2.53
SEMA3A
Q14563
MIR198-201
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62 nt
BASIC
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□□□□□ -2.53
SEMA3A
Q14563
MIR379-201
ENST00000362218
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BASIC
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□□□□□ -2.54
SEMA3A
Q14563
MIR601-201
ENST00000385256
79 nt
BASIC
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□□□□□ -2.54
SEMA3A
Q14563
MIR6502-201
ENST00000617296
76 nt
BASIC
-0.79
□□□□□ -2.54
SEMA3A
Q14563
SNORD19B.1-201
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80 nt
BASIC
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□□□□□ -2.54
SEMA3A
Q14563
RNU6-1169P-201
ENST00000363537
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BASIC
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□□□□□ -2.54
SEMA3A
Q14563
MIR378F-201
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BASIC
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□□□□□ -2.54
SEMA3A
Q14563
MIR3123-201
ENST00000583417
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-0.81
□□□□□ -2.54
SEMA3A
Q14563
MIR6738-201
ENST00000619620
64 nt
BASIC
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□□□□□ -2.54
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.134-201
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105 nt
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□□□□□ -2.54
SEMA3A
Q14563
RNU6-1034P-201
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101 nt
BASIC
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□□□□□ -2.54
SEMA3A
Q14563
RNU6-10P-201
ENST00000384036
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SEMA3A
Q14563
RNU6-724P-201
ENST00000390958
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SEMA3A
Q14563
MIAT_exon5_2.1-201
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SEMA3A
Q14563
MIR4320-201
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SEMA3A
Q14563
RNU6-1324P-201
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□□□□□ -2.54
SEMA3A
Q14563
U6.103-201
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BASIC
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SEMA3A
Q14563
Y_RNA.468-201
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□□□□□ -2.54
SEMA3A
Q14563
MIR548H1-201
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□□□□□ -2.54
SEMA3A
Q14563
MIR548W-201
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BASIC
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SEMA3A
Q14563
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BASIC
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SEMA3A
Q14563
snoU13.10-201
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BASIC
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SEMA3A
Q14563
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SEMA3A
Q14563
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□□□□□ -2.55
SEMA3A
Q14563
MIR4520-1-201
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BASIC
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Q14563
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SEMA3A
Q14563
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SEMA3A
Q14563
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Q14563
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Q14563
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Q14563
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SEMA3A
Q14563
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SEMA3A
Q14563
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BASIC
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SEMA3A
Q14563
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72 nt
BASIC
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□□□□□ -2.56
SEMA3A
Q14563
MIR4306-201
ENST00000583390
91 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
SEMA3A
Q14563
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BASIC
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SEMA3A
Q14563
RNU6-836P-201
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□□□□□ -2.56
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.260-201
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SEMA3A
Q14563
SNORD111B-201
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80 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
SEMA3A
Q14563
U4.2-201
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BASIC
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SEMA3A
Q14563
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□□□□□ -2.56
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.413-201
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BASIC
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SEMA3A
Q14563
Y_RNA.754-201
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SEMA3A
Q14563
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BASIC
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SEMA3A
Q14563
Y_RNA.782-201
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102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.56
SEMA3A
Q14563
MIR1207-201
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BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
SEMA3A
Q14563
MIR548AM-201
ENST00000584298
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BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
SEMA3A
Q14563
RNA5SP86-201
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BASIC
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□□□□□ -2.56
SEMA3A
Q14563
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BASIC
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□□□□□ -2.57
SEMA3A
Q14563
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BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
SEMA3A
Q14563
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BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
SEMA3A
Q14563
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ENST00000362105
72 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
SEMA3A
Q14563
RNU6-345P-201
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107 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
SEMA3A
Q14563
MIR5591-201
ENST00000578248
65 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
SEMA3A
Q14563
MIR3165-201
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75 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
SEMA3A
Q14563
RNU6-485P-201
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107 nt
BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
SEMA3A
Q14563
MIR365A-201
ENST00000362260
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BASIC
-1.05
□□□□□ -2.58
SEMA3A
Q14563
RNU6-706P-201
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104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.58
SEMA3A
Q14563
MIR656-201
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78 nt
BASIC
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BASIC
-1.07
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104 nt
BASIC
-1.08
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102 nt
BASIC
-1.09
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Q14563
MIR1285-2-201
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BASIC
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Y_RNA.647-201
ENST00000459194
112 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
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