Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL9A2Q14055 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL9A2Q14055 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL9A2Q14055 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL9A2Q14055 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL9A2Q14055 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL9A2Q14055 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
COL9A2Q14055 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
COL9A2Q14055 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
COL9A2Q14055 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
COL9A2Q14055 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
COL9A2Q14055 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
COL9A2Q14055 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
COL9A2Q14055 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
COL9A2Q14055 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
COL9A2Q14055 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
COL9A2Q14055 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
COL9A2Q14055 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
COL9A2Q14055 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
COL9A2Q14055 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
COL9A2Q14055 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
COL9A2Q14055 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
COL9A2Q14055 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
COL9A2Q14055 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
COL9A2Q14055 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
COL9A2Q14055 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
COL9A2Q14055 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
COL9A2Q14055 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
COL9A2Q14055 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
COL9A2Q14055 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
COL9A2Q14055 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
COL9A2Q14055 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
COL9A2Q14055 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
COL9A2Q14055 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
COL9A2Q14055 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
COL9A2Q14055 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
COL9A2Q14055 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
COL9A2Q14055 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
COL9A2Q14055 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
COL9A2Q14055 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
COL9A2Q14055 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
COL9A2Q14055 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
COL9A2Q14055 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
COL9A2Q14055 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
COL9A2Q14055 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
COL9A2Q14055 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms