Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL9A3Q14050 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL9A3Q14050 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL9A3Q14050 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL9A3Q14050 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL9A3Q14050 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.4□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
COL9A3Q14050 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
COL9A3Q14050 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
COL9A3Q14050 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
COL9A3Q14050 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
COL9A3Q14050 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
COL9A3Q14050 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
COL9A3Q14050 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
COL9A3Q14050 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
COL9A3Q14050 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
COL9A3Q14050 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
COL9A3Q14050 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
COL9A3Q14050 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL9A3Q14050 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL9A3Q14050 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL9A3Q14050 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL9A3Q14050 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL9A3Q14050 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
COL9A3Q14050 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
COL9A3Q14050 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL9A3Q14050 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL9A3Q14050 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL9A3Q14050 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL9A3Q14050 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL9A3Q14050 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL9A3Q14050 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL9A3Q14050 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL9A3Q14050 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL9A3Q14050 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL9A3Q14050 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL9A3Q14050 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL9A3Q14050 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL9A3Q14050 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL9A3Q14050 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL9A3Q14050 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL9A3Q14050 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL9A3Q14050 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL9A3Q14050 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL9A3Q14050 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
COL9A3Q14050 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.15□□□□□ -2.39
COL9A3Q14050 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
COL9A3Q14050 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
COL9A3Q14050 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL9A3Q14050 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL9A3Q14050 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL9A3Q14050 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL9A3Q14050 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL9A3Q14050 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
COL9A3Q14050 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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