Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ECHDC3Q96DC8 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ECHDC3Q96DC8 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ECHDC3Q96DC8 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ECHDC3Q96DC8 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ECHDC3Q96DC8 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ECHDC3Q96DC8 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ECHDC3Q96DC8 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ECHDC3Q96DC8 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ECHDC3Q96DC8 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ECHDC3Q96DC8 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ECHDC3Q96DC8 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ECHDC3Q96DC8 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ECHDC3Q96DC8 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ECHDC3Q96DC8 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ECHDC3Q96DC8 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ECHDC3Q96DC8 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ECHDC3Q96DC8 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ECHDC3Q96DC8 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ECHDC3Q96DC8 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ECHDC3Q96DC8 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ECHDC3Q96DC8 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ECHDC3Q96DC8 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ECHDC3Q96DC8 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ECHDC3Q96DC8 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ECHDC3Q96DC8 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ECHDC3Q96DC8 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ECHDC3Q96DC8 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ECHDC3Q96DC8 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ECHDC3Q96DC8 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ECHDC3Q96DC8 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ECHDC3Q96DC8 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
ECHDC3Q96DC8 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ECHDC3Q96DC8 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ECHDC3Q96DC8 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ECHDC3Q96DC8 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ECHDC3Q96DC8 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ECHDC3Q96DC8 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ECHDC3Q96DC8 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ECHDC3Q96DC8 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ECHDC3Q96DC8 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ECHDC3Q96DC8 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ECHDC3Q96DC8 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
ECHDC3Q96DC8 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
ECHDC3Q96DC8 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ECHDC3Q96DC8 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ECHDC3Q96DC8 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ECHDC3Q96DC8 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ECHDC3Q96DC8 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ECHDC3Q96DC8 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ECHDC3Q96DC8 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ECHDC3Q96DC8 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ECHDC3Q96DC8 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
ECHDC3Q96DC8 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
ECHDC3Q96DC8 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
ECHDC3Q96DC8 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
ECHDC3Q96DC8 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
ECHDC3Q96DC8 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
ECHDC3Q96DC8 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
ECHDC3Q96DC8 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
ECHDC3Q96DC8 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
ECHDC3Q96DC8 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
ECHDC3Q96DC8 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
ECHDC3Q96DC8 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
ECHDC3Q96DC8 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
ECHDC3Q96DC8 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
ECHDC3Q96DC8 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ECHDC3Q96DC8 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ECHDC3Q96DC8 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ECHDC3Q96DC8 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ECHDC3Q96DC8 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ECHDC3Q96DC8 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
ECHDC3Q96DC8 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
ECHDC3Q96DC8 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
ECHDC3Q96DC8 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
ECHDC3Q96DC8 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
ECHDC3Q96DC8 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 732.6 ms