Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXD1Q16676 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXD1Q16676 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXD1Q16676 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXD1Q16676 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXD1Q16676 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXD1Q16676 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXD1Q16676 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXD1Q16676 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXD1Q16676 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXD1Q16676 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXD1Q16676 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXD1Q16676 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXD1Q16676 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXD1Q16676 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXD1Q16676 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXD1Q16676 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXD1Q16676 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXD1Q16676 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXD1Q16676 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXD1Q16676 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXD1Q16676 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXD1Q16676 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXD1Q16676 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXD1Q16676 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXD1Q16676 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXD1Q16676 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXD1Q16676 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXD1Q16676 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXD1Q16676 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXD1Q16676 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXD1Q16676 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXD1Q16676 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXD1Q16676 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXD1Q16676 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXD1Q16676 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXD1Q16676 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXD1Q16676 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXD1Q16676 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXD1Q16676 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FOXD1Q16676 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FOXD1Q16676 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FOXD1Q16676 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXD1Q16676 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXD1Q16676 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXD1Q16676 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXD1Q16676 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXD1Q16676 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXD1Q16676 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXD1Q16676 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXD1Q16676 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXD1Q16676 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXD1Q16676 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXD1Q16676 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXD1Q16676 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXD1Q16676 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXD1Q16676 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXD1Q16676 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXD1Q16676 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXD1Q16676 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXD1Q16676 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXD1Q16676 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXD1Q16676 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXD1Q16676 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXD1Q16676 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXD1Q16676 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXD1Q16676 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXD1Q16676 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXD1Q16676 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXD1Q16676 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXD1Q16676 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXD1Q16676 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXD1Q16676 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXD1Q16676 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXD1Q16676 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXD1Q16676 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXD1Q16676 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXD1Q16676 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXD1Q16676 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXD1Q16676 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXD1Q16676 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXD1Q16676 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXD1Q16676 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXD1Q16676 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXD1Q16676 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXD1Q16676 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXD1Q16676 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXD1Q16676 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXD1Q16676 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXD1Q16676 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXD1Q16676 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXD1Q16676 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXD1Q16676 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FOXD1Q16676 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FOXD1Q16676 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXD1Q16676 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXD1Q16676 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXD1Q16676 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXD1Q16676 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FOXD1Q16676 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.4 ms