Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMN1Q16637 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMN1Q16637 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SMN1Q16637 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMN1Q16637 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMN1Q16637 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMN1Q16637 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMN1Q16637 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMN1Q16637 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMN1Q16637 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMN1Q16637 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMN1Q16637 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMN1Q16637 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMN1Q16637 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMN1Q16637 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMN1Q16637 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMN1Q16637 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMN1Q16637 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMN1Q16637 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMN1Q16637 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMN1Q16637 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMN1Q16637 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMN1Q16637 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMN1Q16637 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMN1Q16637 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMN1Q16637 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMN1Q16637 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMN1Q16637 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMN1Q16637 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMN1Q16637 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMN1Q16637 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMN1Q16637 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMN1Q16637 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMN1Q16637 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMN1Q16637 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMN1Q16637 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMN1Q16637 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMN1Q16637 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMN1Q16637 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMN1Q16637 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMN1Q16637 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMN1Q16637 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMN1Q16637 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMN1Q16637 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMN1Q16637 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMN1Q16637 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMN1Q16637 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMN1Q16637 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMN1Q16637 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMN1Q16637 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMN1Q16637 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMN1Q16637 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMN1Q16637 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMN1Q16637 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMN1Q16637 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMN1Q16637 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMN1Q16637 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMN1Q16637 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMN1Q16637 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMN1Q16637 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMN1Q16637 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMN1Q16637 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMN1Q16637 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMN1Q16637 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMN1Q16637 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMN1Q16637 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMN1Q16637 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMN1Q16637 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMN1Q16637 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMN1Q16637 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMN1Q16637 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMN1Q16637 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244.1 ms