Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SURF1Q15526 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SURF1Q15526 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SURF1Q15526 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SURF1Q15526 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SURF1Q15526 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SURF1Q15526 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SURF1Q15526 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SURF1Q15526 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SURF1Q15526 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SURF1Q15526 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SURF1Q15526 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SURF1Q15526 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SURF1Q15526 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SURF1Q15526 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SURF1Q15526 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SURF1Q15526 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SURF1Q15526 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SURF1Q15526 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SURF1Q15526 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SURF1Q15526 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SURF1Q15526 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SURF1Q15526 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SURF1Q15526 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SURF1Q15526 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SURF1Q15526 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SURF1Q15526 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SURF1Q15526 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SURF1Q15526 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SURF1Q15526 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SURF1Q15526 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SURF1Q15526 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SURF1Q15526 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SURF1Q15526 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SURF1Q15526 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SURF1Q15526 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SURF1Q15526 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SURF1Q15526 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SURF1Q15526 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SURF1Q15526 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SURF1Q15526 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SURF1Q15526 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SURF1Q15526 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SURF1Q15526 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SURF1Q15526 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SURF1Q15526 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SURF1Q15526 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SURF1Q15526 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SURF1Q15526 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SURF1Q15526 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SURF1Q15526 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SURF1Q15526 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SURF1Q15526 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SURF1Q15526 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SURF1Q15526 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SURF1Q15526 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SURF1Q15526 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SURF1Q15526 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SURF1Q15526 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SURF1Q15526 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SURF1Q15526 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SURF1Q15526 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SURF1Q15526 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SURF1Q15526 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SURF1Q15526 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SURF1Q15526 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SURF1Q15526 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SURF1Q15526 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SURF1Q15526 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SURF1Q15526 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SURF1Q15526 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SURF1Q15526 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SURF1Q15526 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SURF1Q15526 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SURF1Q15526 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SURF1Q15526 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SURF1Q15526 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SURF1Q15526 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SURF1Q15526 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SURF1Q15526 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SURF1Q15526 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SURF1Q15526 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SURF1Q15526 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SURF1Q15526 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SURF1Q15526 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SURF1Q15526 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SURF1Q15526 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SURF1Q15526 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SURF1Q15526 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SURF1Q15526 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SURF1Q15526 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SURF1Q15526 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SURF1Q15526 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SURF1Q15526 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SURF1Q15526 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SURF1Q15526 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SURF1Q15526 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SURF1Q15526 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SURF1Q15526 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SURF1Q15526 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.5 ms