Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms