Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
COL9A3Q14050 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
COL9A3Q14050 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
COL9A3Q14050 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
COL9A3Q14050 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
COL9A3Q14050 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
COL9A3Q14050 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
COL9A3Q14050 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
COL9A3Q14050 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
COL9A3Q14050 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
COL9A3Q14050 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
COL9A3Q14050 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
COL9A3Q14050 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
COL9A3Q14050 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
COL9A3Q14050 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
COL9A3Q14050 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
COL9A3Q14050 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.63□□□□□ -2.31
COL9A3Q14050 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
COL9A3Q14050 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
COL9A3Q14050 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
COL9A3Q14050 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
COL9A3Q14050 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
COL9A3Q14050 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
COL9A3Q14050 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
COL9A3Q14050 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
COL9A3Q14050 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
COL9A3Q14050 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
COL9A3Q14050 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
COL9A3Q14050 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
COL9A3Q14050 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
COL9A3Q14050 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
COL9A3Q14050 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
COL9A3Q14050 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
COL9A3Q14050 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COL9A3Q14050 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COL9A3Q14050 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COL9A3Q14050 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COL9A3Q14050 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COL9A3Q14050 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COL9A3Q14050 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
COL9A3Q14050 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COL9A3Q14050 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COL9A3Q14050 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL9A3Q14050 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COL9A3Q14050 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COL9A3Q14050 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COL9A3Q14050 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COL9A3Q14050 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COL9A3Q14050 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COL9A3Q14050 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COL9A3Q14050 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COL9A3Q14050 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COL9A3Q14050 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COL9A3Q14050 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COL9A3Q14050 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COL9A3Q14050 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COL9A3Q14050 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COL9A3Q14050 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COL9A3Q14050 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COL9A3Q14050 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL9A3Q14050 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL9A3Q14050 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL9A3Q14050 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL9A3Q14050 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL9A3Q14050 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL9A3Q14050 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL9A3Q14050 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL9A3Q14050 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL9A3Q14050 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL9A3Q14050 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL9A3Q14050 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL9A3Q14050 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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