Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD8P13378 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD8P13378 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD8P13378 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD8P13378 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD8P13378 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD8P13378 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD8P13378 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD8P13378 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HOXD8P13378 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HOXD8P13378 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXD8P13378 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXD8P13378 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXD8P13378 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXD8P13378 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXD8P13378 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXD8P13378 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXD8P13378 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXD8P13378 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXD8P13378 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXD8P13378 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
HOXD8P13378 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.3 ms