Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.66□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
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KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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