Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RBM42Q9BTD8 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBM42Q9BTD8 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBM42Q9BTD8 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBM42Q9BTD8 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBM42Q9BTD8 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBM42Q9BTD8 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBM42Q9BTD8 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBM42Q9BTD8 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RBM42Q9BTD8 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RBM42Q9BTD8 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RBM42Q9BTD8 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RBM42Q9BTD8 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RBM42Q9BTD8 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RBM42Q9BTD8 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RBM42Q9BTD8 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RBM42Q9BTD8 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
RBM42Q9BTD8 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RBM42Q9BTD8 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RBM42Q9BTD8 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RBM42Q9BTD8 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RBM42Q9BTD8 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RBM42Q9BTD8 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RBM42Q9BTD8 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RBM42Q9BTD8 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RBM42Q9BTD8 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RBM42Q9BTD8 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RBM42Q9BTD8 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RBM42Q9BTD8 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RBM42Q9BTD8 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RBM42Q9BTD8 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBM42Q9BTD8 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBM42Q9BTD8 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RBM42Q9BTD8 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RBM42Q9BTD8 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RBM42Q9BTD8 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RBM42Q9BTD8 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RBM42Q9BTD8 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RBM42Q9BTD8 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RBM42Q9BTD8 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RBM42Q9BTD8 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RBM42Q9BTD8 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RBM42Q9BTD8 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RBM42Q9BTD8 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RBM42Q9BTD8 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RBM42Q9BTD8 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RBM42Q9BTD8 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
RBM42Q9BTD8 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RBM42Q9BTD8 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RBM42Q9BTD8 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBM42Q9BTD8 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBM42Q9BTD8 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBM42Q9BTD8 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBM42Q9BTD8 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBM42Q9BTD8 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBM42Q9BTD8 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBM42Q9BTD8 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBM42Q9BTD8 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RBM42Q9BTD8 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBM42Q9BTD8 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBM42Q9BTD8 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBM42Q9BTD8 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBM42Q9BTD8 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBM42Q9BTD8 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBM42Q9BTD8 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RBM42Q9BTD8 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RBM42Q9BTD8 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RBM42Q9BTD8 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RBM42Q9BTD8 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RBM42Q9BTD8 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RBM42Q9BTD8 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RBM42Q9BTD8 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RBM42Q9BTD8 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RBM42Q9BTD8 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RBM42Q9BTD8 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
RBM42Q9BTD8 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RBM42Q9BTD8 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RBM42Q9BTD8 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RBM42Q9BTD8 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RBM42Q9BTD8 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RBM42Q9BTD8 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
RBM42Q9BTD8 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RBM42Q9BTD8 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RBM42Q9BTD8 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RBM42Q9BTD8 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RBM42Q9BTD8 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RBM42Q9BTD8 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RBM42Q9BTD8 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RBM42Q9BTD8 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RBM42Q9BTD8 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RBM42Q9BTD8 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RBM42Q9BTD8 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBM42Q9BTD8 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBM42Q9BTD8 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBM42Q9BTD8 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RBM42Q9BTD8 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RBM42Q9BTD8 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RBM42Q9BTD8 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.8 ms