Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MKRN4PQ13434 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MKRN4PQ13434 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MKRN4PQ13434 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MKRN4PQ13434 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MKRN4PQ13434 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MKRN4PQ13434 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MKRN4PQ13434 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MKRN4PQ13434 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MKRN4PQ13434 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MKRN4PQ13434 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MKRN4PQ13434 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MKRN4PQ13434 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MKRN4PQ13434 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MKRN4PQ13434 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MKRN4PQ13434 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
MKRN4PQ13434 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MKRN4PQ13434 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MKRN4PQ13434 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MKRN4PQ13434 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MKRN4PQ13434 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MKRN4PQ13434 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MKRN4PQ13434 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MKRN4PQ13434 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MKRN4PQ13434 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MKRN4PQ13434 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MKRN4PQ13434 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MKRN4PQ13434 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MKRN4PQ13434 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MKRN4PQ13434 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MKRN4PQ13434 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MKRN4PQ13434 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MKRN4PQ13434 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MKRN4PQ13434 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MKRN4PQ13434 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MKRN4PQ13434 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MKRN4PQ13434 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MKRN4PQ13434 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MKRN4PQ13434 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MKRN4PQ13434 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MKRN4PQ13434 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MKRN4PQ13434 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MKRN4PQ13434 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MKRN4PQ13434 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MKRN4PQ13434 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MKRN4PQ13434 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MKRN4PQ13434 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MKRN4PQ13434 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MKRN4PQ13434 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MKRN4PQ13434 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MKRN4PQ13434 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MKRN4PQ13434 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MKRN4PQ13434 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MKRN4PQ13434 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MKRN4PQ13434 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MKRN4PQ13434 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MKRN4PQ13434 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MKRN4PQ13434 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MKRN4PQ13434 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MKRN4PQ13434 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MKRN4PQ13434 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MKRN4PQ13434 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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MKRN4PQ13434 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MKRN4PQ13434 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MKRN4PQ13434 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MKRN4PQ13434 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MKRN4PQ13434 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MKRN4PQ13434 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MKRN4PQ13434 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MKRN4PQ13434 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MKRN4PQ13434 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MKRN4PQ13434 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MKRN4PQ13434 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MKRN4PQ13434 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MKRN4PQ13434 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MKRN4PQ13434 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MKRN4PQ13434 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MKRN4PQ13434 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MKRN4PQ13434 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MKRN4PQ13434 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MKRN4PQ13434 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MKRN4PQ13434 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MKRN4PQ13434 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MKRN4PQ13434 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MKRN4PQ13434 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MKRN4PQ13434 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MKRN4PQ13434 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MKRN4PQ13434 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MKRN4PQ13434 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MKRN4PQ13434 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MKRN4PQ13434 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MKRN4PQ13434 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MKRN4PQ13434 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MKRN4PQ13434 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MKRN4PQ13434 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MKRN4PQ13434 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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