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Protein–RNA interactions for Protein: Q16799
RTN1, Reticulon-1, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
RTN1
Q16799
AC098934.3-201
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190 nt
BASIC
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□□□□□ -2.27
RTN1
Q16799
RNU6-782P-201
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104 nt
BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
RTN1
Q16799
MIR760-201
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80 nt
BASIC
0.86
□□□□□ -2.27
RTN1
Q16799
TRGJP-201
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61 nt
APPRIS P1
BASIC
0.86
□□□□□ -2.27
RTN1
Q16799
RNU7-129P-201
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62 nt
BASIC
0.86
□□□□□ -2.27
RTN1
Q16799
RNU6-980P-201
ENST00000516925
103 nt
BASIC
0.86
□□□□□ -2.27
RTN1
Q16799
MIR4677-201
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80 nt
BASIC
0.86
□□□□□ -2.27
RTN1
Q16799
MIR7110-201
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BASIC
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□□□□□ -2.27
RTN1
Q16799
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□□□□□ -2.27
RTN1
Q16799
RNU6ATAC29P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.27
RTN1
Q16799
RNU7-119P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.27
RTN1
Q16799
RPS29P1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.27
RTN1
Q16799
MIR4452-201
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BASIC
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□□□□□ -2.27
RTN1
Q16799
SPRY4-IT1_2.1-201
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121 nt
BASIC
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□□□□□ -2.27
RTN1
Q16799
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□□□□□ -2.27
RTN1
Q16799
RNU6-617P-201
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□□□□□ -2.27
RTN1
Q16799
RNU6-473P-201
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□□□□□ -2.27
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Q16799
RNU6-1049P-201
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□□□□□ -2.27
RTN1
Q16799
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108 nt
BASIC
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□□□□□ -2.28
RTN1
Q16799
RNU6-945P-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.28
RTN1
Q16799
MIR499A-201
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122 nt
BASIC
0.83
□□□□□ -2.28
RTN1
Q16799
MIRLET7B-201
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83 nt
BASIC
0.83
□□□□□ -2.28
RTN1
Q16799
Y_RNA.676-201
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96 nt
BASIC
0.83
□□□□□ -2.28
RTN1
Q16799
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69 nt
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□□□□□ -2.28
RTN1
Q16799
MIR3925-201
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77 nt
BASIC
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□□□□□ -2.28
RTN1
Q16799
AC084368.1-201
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BASIC
0.83
□□□□□ -2.28
RTN1
Q16799
U2.18-201
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84 nt
BASIC
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□□□□□ -2.28
RTN1
Q16799
AP000676.1-201
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52 nt
BASIC
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□□□□□ -2.28
RTN1
Q16799
MIR4490-201
ENST00000582647
84 nt
BASIC
0.82
□□□□□ -2.28
RTN1
Q16799
MIR6835-201
ENST00000621552
64 nt
BASIC
0.82
□□□□□ -2.28
RTN1
Q16799
CALCRL-202
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5223 nt
APPRIS P1
TSL 5
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□□□□□ -2.28
RTN1
Q16799
RNU6-458P-201
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107 nt
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□□□□□ -2.28
RTN1
Q16799
RNU6-246P-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.28
RTN1
Q16799
MIR146A-201
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99 nt
BASIC
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□□□□□ -2.28
RTN1
Q16799
SNORD2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.28
RTN1
Q16799
U6.58-201
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RTN1
Q16799
RNU4-33P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.28
RTN1
Q16799
RNU6-598P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.28
RTN1
Q16799
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BASIC
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□□□□□ -2.28
RTN1
Q16799
MIR106A-201
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RTN1
Q16799
RNU6-863P-201
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104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.28
RTN1
Q16799
uc_338.36-201
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158 nt
BASIC
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RTN1
Q16799
MIR508-201
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115 nt
BASIC
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□□□□□ -2.28
RTN1
Q16799
SNORA40B-201
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128 nt
BASIC
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RTN1
Q16799
MIR4653-201
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83 nt
BASIC
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□□□□□ -2.28
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Q16799
AL353803.5-201
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141 nt
BASIC
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RTN1
Q16799
TRAJ22-201
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63 nt
APPRIS P1
BASIC
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□□□□□ -2.29
RTN1
Q16799
CEP290-203
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5968 nt
TSL 1 (best)
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□□□□□ -2.29
RTN1
Q16799
RNU6ATAC31P-201
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RTN1
Q16799
MIR548J-201
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RTN1
Q16799
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Q16799
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BASIC
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Q16799
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BASIC
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□□□□□ -2.29
RTN1
Q16799
RNU7-88P-201
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RTN1
Q16799
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BASIC
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□□□□□ -2.29
RTN1
Q16799
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BASIC
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Q16799
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□□□□□ -2.29
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Q16799
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RTN1
Q16799
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Q16799
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Q16799
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Q16799
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Q16799
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Q16799
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Q16799
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RTN1
Q16799
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RTN1
Q16799
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RTN1
Q16799
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BASIC
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Q16799
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Q16799
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RTN1
Q16799
RNA5SP470-201
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BASIC
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RTN1
Q16799
MIR1287-201
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BASIC
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RTN1
Q16799
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RTN1
Q16799
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BASIC
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RTN1
Q16799
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82 nt
BASIC
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RTN1
Q16799
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BASIC
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□□□□□ -2.3
RTN1
Q16799
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BASIC
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Q16799
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163 nt
BASIC
0.68
□□□□□ -2.3
RTN1
Q16799
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ENST00000614149
7911 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
0.68
□□□□□ -2.3
RTN1
Q16799
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ENST00000401147
81 nt
BASIC
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□□□□□ -2.3
RTN1
Q16799
RNU6-1262P-201
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96 nt
BASIC
0.67
□□□□□ -2.3
RTN1
Q16799
MIR6888-201
ENST00000621977
67 nt
BASIC
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□□□□□ -2.3
RTN1
Q16799
RNU6-815P-201
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113 nt
BASIC
0.66
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RTN1
Q16799
RNU6-974P-201
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BASIC
0.66
□□□□□ -2.3
RTN1
Q16799
MIR92A1-201
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78 nt
BASIC
0.66
□□□□□ -2.3
RTN1
Q16799
MIR5000-201
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103 nt
BASIC
0.66
□□□□□ -2.3
RTN1
Q16799
MIR4464-201
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92 nt
BASIC
0.66
□□□□□ -2.3
RTN1
Q16799
MIRLET7D-201
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BASIC
0.65
□□□□□ -2.31
RTN1
Q16799
MIR545-201
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106 nt
BASIC
0.65
□□□□□ -2.31
RTN1
Q16799
MIR548F3-201
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BASIC
0.65
□□□□□ -2.31
RTN1
Q16799
RNU6-1267P-201
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BASIC
0.65
□□□□□ -2.31
RTN1
Q16799
snoR1.1-201
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80 nt
BASIC
0.65
□□□□□ -2.31
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Q16799
Y_RNA.69-201
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109 nt
BASIC
0.64
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RTN1
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BASIC
0.64
□□□□□ -2.31
RTN1
Q16799
RNU6ATAC20P-201
ENST00000408436
127 nt
BASIC
0.64
□□□□□ -2.31
RTN1
Q16799
RNU6-1223P-201
ENST00000517124
104 nt
BASIC
0.64
□□□□□ -2.31
RTN1
Q16799
MIR5704-201
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77 nt
BASIC
0.64
□□□□□ -2.31
RTN1
Q16799
RNA5SP247-201
ENST00000411181
105 nt
BASIC
0.63
□□□□□ -2.31
RTN1
Q16799
RNU6-419P-201
ENST00000517030
63 nt
BASIC
0.63
□□□□□ -2.31
RTN1
Q16799
MIR8068-201
ENST00000618032
68 nt
BASIC
0.63
□□□□□ -2.31
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