Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NCAPHQ15003 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NCAPHQ15003 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
NCAPHQ15003 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NCAPHQ15003 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NCAPHQ15003 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NCAPHQ15003 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NCAPHQ15003 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NCAPHQ15003 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NCAPHQ15003 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NCAPHQ15003 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NCAPHQ15003 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NCAPHQ15003 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NCAPHQ15003 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NCAPHQ15003 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NCAPHQ15003 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NCAPHQ15003 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NCAPHQ15003 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NCAPHQ15003 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NCAPHQ15003 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NCAPHQ15003 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NCAPHQ15003 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NCAPHQ15003 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NCAPHQ15003 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NCAPHQ15003 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NCAPHQ15003 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NCAPHQ15003 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NCAPHQ15003 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NCAPHQ15003 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NCAPHQ15003 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NCAPHQ15003 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NCAPHQ15003 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NCAPHQ15003 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NCAPHQ15003 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NCAPHQ15003 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NCAPHQ15003 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NCAPHQ15003 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NCAPHQ15003 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NCAPHQ15003 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NCAPHQ15003 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NCAPHQ15003 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NCAPHQ15003 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NCAPHQ15003 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NCAPHQ15003 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NCAPHQ15003 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NCAPHQ15003 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NCAPHQ15003 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NCAPHQ15003 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NCAPHQ15003 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.6 ms