Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.4 ms