Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.02
CPSF1Q10570 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.02
CPSF1Q10570 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.02
CPSF1Q10570 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.02
CPSF1Q10570 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
CPSF1Q10570 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
CPSF1Q10570 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
CPSF1Q10570 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
CPSF1Q10570 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
CPSF1Q10570 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
CPSF1Q10570 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
CPSF1Q10570 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
CPSF1Q10570 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
CPSF1Q10570 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
CPSF1Q10570 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
CPSF1Q10570 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
CPSF1Q10570 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
CPSF1Q10570 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
CPSF1Q10570 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
CPSF1Q10570 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-3.86□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-3.86□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-3.86□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
CPSF1Q10570 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
CPSF1Q10570 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
CPSF1Q10570 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
CPSF1Q10570 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
CPSF1Q10570 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
CPSF1Q10570 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
CPSF1Q10570 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
CPSF1Q10570 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
CPSF1Q10570 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
CPSF1Q10570 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
CPSF1Q10570 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
CPSF1Q10570 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
CPSF1Q10570 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
CPSF1Q10570 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
CPSF1Q10570 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
CPSF1Q10570 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
CPSF1Q10570 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
CPSF1Q10570 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
CPSF1Q10570 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
CPSF1Q10570 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
CPSF1Q10570 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
CPSF1Q10570 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
CPSF1Q10570 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
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