Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms