Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3550W4VSN7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms