Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm17190V9GX38 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm17190V9GX38 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm17190V9GX38 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm17190V9GX38 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm17190V9GX38 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm17190V9GX38 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm17190V9GX38 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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