Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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