Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm4T1NXB5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms