Protein–RNA interactions for Protein: S4R1M3

H2afb2, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afb2S4R1M3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb2S4R1M3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms