Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms