Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms