Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms