Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms