Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X0

Ccl27, C-C motif chemokine 27, mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl27Q9Z1X0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ccl27Q9Z1X0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ccl27Q9Z1X0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ccl27Q9Z1X0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ccl27Q9Z1X0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl27Q9Z1X0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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