Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VarsQ9Z1Q9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms