Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setbp1Q9Z180 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Setbp1Q9Z180 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms