Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms