Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rspo1Q9Z132 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rspo1Q9Z132 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms