Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cldn3Q9Z0G9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms